Autor: A.D. Baxevanisa, B.F.F. Ouellette'a

ISBN: 83-01-14211-1

Ilość stron: 506

Data wydania: 2005 (dodruk 2006)

Książka "Bioinformatyka podręcznik do analizy genów i białek" zawiera bardzo przejrzysty i kompletny opis metod algorytmicznych, technik analizy porównawczej, analizy statystycznej i przewidywania teoretycznego struktur molekularnych na kolejnych poziomach organizacji. Znajdujące się na końcu każdego rozdziału adresy stron WWW wskazują drogę do opisywanych narzędzi i baz danych. Książka może służyć zarówno jako sprawdzony podręcznik dla studentów, jak i przewodnik dla zaawansowanych specjalistów.

Opinie o książce:
Podręcznik stanowi bezcenną pomoc dla biologów molekularnych, zarówno nauczycieli jak i studentów oraz badaczy prowadzących prace eksperymentalne. Jest uniwersalną lekturą dla osób zajmujących się zarówno analizą kwasów nukleinowych jak i białek. Zawarty w nim przewodnik po internetowych bazach danych uważam za znakomity [...] umożliwiający szybkie i precyzyjne wyszukiwanie interesujących sekwencji DNA, RNA i polipeptydów oraz ułatwiający planowanie eksperymentów badawczych. [...] Ćwiczenia zamieszczone na końcu poszczególnych rozdziałów dają możliwość zastosowania w praktyce zdobytej wiedzy...
(prof. dr Marian Filipiak, Akademia Ekonomiczna w Poznaniu)

[...] publikacja jest przydatna w nauczaniu studentów na kierunku Ochrona środowiska, specjalności Biotechnologia molekularna. Może być wykorzystana w procesie kształcenia z zakresu biologii komórki, genetyki molekularnej, regulacji metabolizmu czy biotechnologii. Niewątpliwą zaletą podręcznika jest jasne i przejrzyste przedstawienie omawianych w nim zagadnień przybliżających podejście informatyczne do zagadnień biologicznych. [...] wartość dydaktyczną podnosi fakt zamieszczenia po każdym rozdziale adresów stron internetowych i spisu literatury uzupełniającej...
(Agnieszka Janiak-Osajca, Uniwersytet Zielonogórski)

[...] Jest to pierwszy wydany w języku polskim podręcznik bioinformatyki. Bioinformatyka stała się w ostatnich latach jedną z głównych "specjalności naukowych" Polski. [...] podczas ostatniej edycji światowego "konkursu" w przewidywaniu struktury białek (CASP6) [...] spośród ponad 200 grup biorących udział w tym eksperymencie [...] dwie pierwsze grupy były polskie. Stąd waga tej publikacji dla szkolenia studentów i doskonalenia zawodowego pracowników naukowych. [...] W książce można znaleźć odniesienia do chyba wszystkich współczesnych metod bioinformatycznych, co jest bardzo ważną zaletą tej publikacji. [...] Bardzo przydatny jako przewodnik encyklopedyczny w laboratoriach, gdzie wykonuje się stale bądź doraźnie prace bioinformatyczne...
(prof. dr hab. Andrzej Koliński, Uniwersytet Warszawski)

Rozdziały:

1. Bioinformatyka i Internet     1

2. Model Danych NCBI     19

3. GenBank - baza danych sekwencji   46

4. Wprowadzanie sekwencji DNA do baz danych    68

5. Bazy danych struktur biomolekularnych   88

6. Mapowanie genomów i bazy danych map    114

7. Pobieranie informacji z biologicznych baz danych    164

8. Dopasowywanie sekwencji i przeszukiwanie baz danych    197

9. Tworzenie i analiza zestawień dopasowanych sekwecji białek   229

10. Metody przewidywania regionów kodujących w sekwencjach DNA   248

11. Metody przewidywania wykorzystujące sekwencję białek    270

12. Znaczniki sekwencji ulegających ekspresji (EST)   302

13. Składanie sekwencji i metody dokańczające   323

14. Analizy filogenetyczne   342

15. Analiza porównawcza genomów    384

16. Analiza wielkoskalowa genomu   422

17. Perl jako narzędzie ułatwiajace analizę biologiczną   441

Słowniczek    479